Quando o manifesto é emitido eletronicamente, a sefaz pode rejeitar o documento emitido, sendo nesse caso retornado um código de rejeição especificando o motivo de o documento não ter sido aceito. Nesta página estão listadas páginas específicas sobre rejeições, contendo mais informações sobre elas.
Quando um manifesto é rejeitado, seu status fica como Erro no Processamento. No campo Status SEFAZ é mostrado o código da rejeição, e em Desc. Status SEFAZ, sua descrição.